微陣列芯片應(yīng)用流程
1制備靶點
從生物標(biāo)本中提取核苷酸并進(jìn)行標(biāo)記,;
2雜交
讓靶點與芯片上的cdna或寡核苷酸序列進(jìn)行孵育,;
3獲取數(shù)據(jù)
掃描與探針雜交的靶點表現(xiàn)出來的信號強度
4數(shù)據(jù)分析
從大量數(shù)據(jù)中得出具有生物學(xué)意義的結(jié)論
微陣列芯片技術(shù)通過測定能夠與探針雜交的mrna的數(shù)量,反映表達(dá)此mrna的基因的轉(zhuǎn)錄情況,,芯片的構(gòu)建首先要根據(jù)研究的需要選擇基因及相應(yīng)的探針,基因芯片,,其次是從標(biāo)本中提取mrna,,并制備出靶點,然后將靶點加入芯片,,進(jìn)行孵育雜交,、沖洗掉沒有雜交的樣品以及掃描等操作,,得到原始數(shù)據(jù),再將這些數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化和統(tǒng)計分析后得到結(jié)論,,構(gòu)造適當(dāng)?shù)奈㈥嚵行酒情_展后續(xù)研究的基礎(chǔ),。
主要原因是,合成反應(yīng)每步產(chǎn)率比較低,,不到 95% ,。而通常固相合成反應(yīng)每步的產(chǎn)率在 99% 以上。因此,,探針的長度受到了---,。而且由于每步去保護(hù)不很,基因芯片分析,,致使雜交信號比較模糊,,信噪比降低。為此有人將光引導(dǎo)合成技術(shù)與半異體工業(yè)所用的光敏抗蝕技術(shù)相結(jié)合,,以酸作為去保護(hù)劑,,使每步產(chǎn)率增加到 98% 。原因是光敏抗蝕劑的解離對照度的依賴是非線性的,,基因芯片掃描,,當(dāng)照度達(dá)到特定的閾值以上保護(hù)劑就會解離。所以,,該方法同時也解決了由于蔽光膜透光孔間距離縮小而基因芯片引起的光衍射問題,,基因芯片結(jié)果,有效地提高了聚合點陣的密度,。另據(jù)報導(dǎo) ,,利用波長更短的物質(zhì)波如電子射線去除保護(hù)可使點陣密度達(dá)到 1010/cm2 。
3.微珠芯片技術(shù)
微珠芯片技術(shù)(beadarray) 技術(shù)是一一種新的基因芯片技術(shù),,有可能成為今后基因芯片技術(shù)發(fā)展的方向,。目前,微珠芯片技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的用途主要集中在snp及基因型分析,、基因表達(dá)譜分析和蛋白組學(xué)研究三大領(lǐng)域,。微珠芯片技術(shù)是在光導(dǎo)纖維技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起.來的技術(shù)。在直徑為3. 5mm的光纖束中,,包含約50000跟光纖,。
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